Misión
Somos una Institución Educativa inclusiva, intercultural, democrática y ambientalista; brinda una educación de calidad científica humanista a estudiantes de nivel secundario, con una organización institucional, liderazgo pedagógico, infraestructura moderna, maestros innovadores, estudiantes proactivos y padres de familia comprometidos por la educación de sus hijos.
Visión
La Institución Educativa Emblemática «Santo Tomás», al 2022 será una institución educativa acreditada, con estudiantes egresados con formación científica, humanística, ambientalista, inclusivo, intercultural, emprendedores y lideres; con altas expectativas académicas, sociales, deportivas, culturales y con gestión participativa de la comunidad educativa.
RESEÑA HISTORICA
El 25 de Octubre del 2010 se da la Resolución Ministerial N° 0318-2010-ED, donde se resuelve, «Incorporar al Programa Nacional de Recuperación de la Instituciones Educativas Emblemáticas y Centenarias al Colegio Nacional Mixto «Santo Tomás» refrendado por el Ministro de educacion José Antonio Chang Escobedo. En la cual el Congresista de la Republica por el departamento de Cusco Dr. Luis Wilson Ugarte, tuvouna una decisiva participación para que el Colegio mas antiguo y mas grande de la provincia de Chumbivilcas sea incorporado como Emblematico. El 19 de octubre de 2010 se recibe el Oficio N° 7977-2010 DP/SGPR dirigido al Director del Colegio Prof. Dolores Benito Calderón, haciendo conocer el Colegio Nacional Mixto «Santo Tomás» esta considerado dentro del Programa Nacional de los «Colegios Emblematicos», firmado por el presidente de la Republica Dr. Alan Garcia Pérez.